Wichtigstes Entscheidungsgremium ist der einmal im Jahr stattfindende Bauerntag, zu dem aus jedem Regional- und Kreisbauernverband Delegierte entsandt werden. Diese fassen Beschlüsse zu allen wirtschaftspolitischen und berufsständischen Fragen von allgemeiner und grundsätzlicher Bedeutung und wählen alle vier Jahre einen Präsidenten bzw. eine Präsidentin, die drei Vizepräsidenten sowie die Mitglieder der Revisionskommission in geheimer Wahl. Gemeinsam mit dem Hauptgeschäftsführer des Verbandes bilden sie den geschäftsführenden Vorstand.
Die Vorsitzenden der Regional- und Kreisbauernverbände bilden den Landesvorstand. Gemeinsam mit den Mitgliedern des geschäftsführenden Vorstands treibt der Landesvorstand zwischen den Sitzungen des Präsidiums die politische Meinungsbildung zu agrarpolitischen Fragen voran.
Karsten Trunk
Präsident
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Sabine Firnhaber
Vizepräsidentin
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Marco Gemballa
Vizepräsident
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Dr. Manfred Leberecht
Vizepräsident
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Dr. Martin Piehl
Hauptgeschäftsführer
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Karsten Trunk
Präsident
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Daniel Bohl
Vorstandsvorsitz
Kreisbauernverband Nordwestmecklenburg e. V.
Jörg Espig
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Ostvorpommern e. V.
Sabine Firnhaber
Vizepräsidentin
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Matthias Hantel
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Güstrow e. V.
Heiko Jahns
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Demmin e. V.
Toni Jaschinski
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Mecklenburg-Strelitz e. V.
Dr. Manfred Leberecht
Vizepräsident
Bauernverband Mecklenburg-Vorpommern e. V.
Armin Lüth
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Bützow e. V.
Siegfried Martinmaas
Bauernverband Güstrow e. V.
Frank Piehl
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Parchim e. V.
Tilo Radloff
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Altentreptow e. V.
Emanuel Reim
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Uecker-Randow e. V.
Rico Remien
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Rügen e. V.
Christian Rohlfing
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Nordvorpommern e. V.
Jan-Hendrik Rust
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Müritz e. V.
Tim Schmüser
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Ludwigslust e. V.
Dagmar Söhnholz
Vorstandsvorsitzende
Bauernverband Bad Doberan e. V.
Claus-Dieter Tobaben
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Malchin e. V.
Johann Tophoff-Kaup
Vorstandsvorsitz
Bauernverband Rügen e. V.